1.1 Milliy Biotexnologiya Axborot Markaziga (NCBI) kirish
Kirish
Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) Milliy Sog’liqni saqlash instituti (NIH) filiali bo’lgan Amerika Qo’shma Shtatlari Milliy Tibbiyot Kutubxonasi (NLM) tarkibiga kiradi. Bu asosiy ma’lumotlar bazasi, birlamchi ma’lumotlar bazalari tabiatan arxivdir. Ular nukleotidlar ketma-ketligi, oqsillar ketma-ketligi yoki makromolekulyar tuzilish kabi eksperimental olingan ma’lumotlardan iborat. Eksperimental natijalar tadqiqotchilar tomonidan to’g’ridan-to’g’ri ma’lumotlar bazasiga yuboriladi.
NCBI asosiy ma’lumotlar bazasi bo’lib, biotexnologiya va biomeditsinaga tegishli 32 ta kichik ma’lumotlar bazasini o’z ichiga oladi va bioinformatika vositalari va xizmatlari uchun muhim manba hisoblanadi. Har bir ma’lumotlar bazasi turli xil ma’lumotlarni o’z ichiga oladi. Ushbu video NCBI funksionalligi, NCBI ning 32 ta kichik ma’lumotlar bazasi va LCT geni bo’yicha ketma-ketlik tahlili haqida bosqichma-bosqich ma’lumotdan iborat.
Qadamlar
- NCBI bosh sahifasida bizni qiziqtirgan ma’lumotlarni va qidirish uchun so’rovlar oynasini olishimiz mumkin bo’lgan turli pastki ma’lumotlar bazalari mavjud.
- Jami 32 ta kichik maʼlumotlar bazasi mavjud boʻlib, ular orasida Biokoleksiyonlar, Assambleya, Protein, Gen, Nukleotid, BioProject, OMIM, Kitoblar va turli maʼlumotlarga ega boʻlgan boshqa turli xil maʼlumotlar mavjud.
- So’rov maydoniga LCT, laktaza fermentini ishlab chiqaruvchi gen uchun kalit so’zni kiriting.
- Uni barcha maʼlumotlar bazalari orqali qidiring.
- Qidiruv natijasi barcha maʼlumotlar bazalarida LCT kalit soʻzining havolasini koʻrsatadi. Homo sapiens qidiruvning eng ehtimoliy qiziqishi sifatida tilga olinadi,
- NCBI natijalarni turli sub-ma’lumotlar bazasi toifalariga ajratadi.
- Turkumlar kitoblar, maqolalar, ilmiy maqolalarga ega boʻlgan adabiyotlar, ularda LCT tilga olingan, genni taʼminlovchi turli organizmlar, Geo DataSets Geo profili gen ekspresyon tahlili, HomologGene homologiya tahlili va PopSet organizmlar toʻplamida gen populyatsiyasi tahlili. Boshqa toifalar Proteomika uchun oqsillar, moddalar birikmalari va ularning xossalarini topish uchun kimyoviy moddalar, Genotip-fenotip munosabatlari uchun genetika, Genomik ma’lumotlar uchun genomlar.
- Gennom toifasidan turli organizmlardagi LCT genining jami 7856 ta referent nukleotidlar ketma-ketligini ko’rsatadigan Nukleotidlar ma’lumotlar bazasini bosing.
- Bu Homo sapiensning LCT geni sifatida eng ehtimoliy qidiruv qiziqishini ko’rsatadi va undan pastroqda birinchi sahifada LCT genining 7865 ta mos yozuvlar ketma-ketligidan 20 ta mos yozuvlar ketma-ketligi ro’yxati mavjud bo’lib, ular har bir sahifada 200 ta havolaga qadar kengaytirilishi mumkin.
Xulosa
NCBI - bu butun dunyo tadqiqotchilari tomonidan to’plangan turli xil ma’lumotlar to’plamlariga ega bo’lgan jami 32 kichik ma’lumotlar bazasidan iborat xosting ma’lumotlar bazasi. Ushbu videoda biz NCBI funksiyasi va NCBI qidiruv toifalarini muhokama qildik. Biz LCT deb nomlangan gen bo’yicha ketma-ketlik tahlilini o’tkazdik va uni barcha ma’lumotlar bazalari bo’ylab qidirdik va turli ma’lumotlar bazasidagi havolalarni topdik va keyin Genom toifasidan Nukleotidlar ma’lumotlar bazasiga o’tdik, u erda biz LCT genining mos yozuvlar ketma-ketligini tomosha qildik.
Vazifa
NCBI ga o’ting va HTT ni barcha ma’lumotlar bazalarida qidiring va natijani tahlil qiling.
Manba linki